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【教学科研】我校动科院师生共同完成的科研论文“大规模全基因组重测序检测绒山羊的选择信号”发表于《Scientific Reports》

发布日期:2017年12月09日 11:58 来源: 浏览数:

  近日,由我校動物科學學院博士研究生李曉凱,教師蘇蕊爲共同第一作者,李金泉教授爲通訊作者完成的科研論文《Identification of selection signals by large-scale whole-genome resequencingof cashmere goats》(《大規模全基因組重測序檢測絨山羊的選擇信號》),在Nature(《自然》)旗下的《Scientific Reports》(《科學報告》)期刊發表。

  該研究成果利用70只絨山羊的全基因組測序數據,系統分析了內蒙古絨山羊3個類群(阿拉善型、阿爾巴斯型和二狼山型)和遼甯絨山羊的群體遺傳結構和系統發生關系,爲在基因組水平揭示絨山羊的遺傳結構特征、遺傳多樣性以及遺傳資源保護、利用提供了借鑒。此外,研究還利用14只非産絨山羊個體的全基因組數據對絨山羊群體進行了與絨毛生長、適應性等性狀相關的選擇性清除掃描檢測。對絨山羊群體中的受選擇區域進行了功能注釋分析,篩選得到6個與絨山羊絨毛生長發育相關的重要候選基因,爲後續深入研究絨毛生長發育的遺傳標記提供了理論基礎。該研究表明,全基因組重測序可以作爲山羊功能定位的有效工具,基于選擇性清除分析方法獲得的候選基因和功能突變爲後續功能驗證和選擇育種提供了新的思路。

  該研究由我校農業部肉羊遺傳育種重點實驗室、自治區動物遺傳育種與繁殖重點實驗室、自治區山羊遺傳育種工程技術研究中心,以及我校動物科學學院李金泉教授研究團隊聯合中國科學院昆明動物研究所等單位共同完成。研究經費主要由李金泉教授主持的國家高技術研究發展計劃“863”計劃(2013AA102506)和蘇蕊副教授主持的國家自然科學基金項目(31660639)等項目資助。

  據了解,《ScientificReports》是Nature出版集團于2011年新創刊的綜合性期刊,涵蓋自然科學的所有領域,是Nature目前主推的開放存取(Open AccessOA)的期刊,2016年該期刊影響因子爲4.259

   論文鏈接:

http://www.nature.com/articles/s41598-017-15516-0

 

 

 

 

   

   

                絨山羊受到強烈選擇作用的候選基因區域    

 

 

 

 

 

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